企业是不是降税？
首先，对题主的疑问写一份长一点的解答。 税收是一个国家对一个社会群体（纳税人）进行无偿征收（不交返还在未来某个时间给予补偿）且强制征收（拒绝缴纳将依法强制执行）一笔资金的行为。因此从这个定义来看，无论是免税还是减税都不属于降低税率的问题；并且从国际社会的惯例来看，国家之间因为政治、经济等原因出现的减免税情况也非常普遍，这种“不以征税为前提条件的”的减免税，本质上应该算作财政补贴的一种形式。
目前中国存在的税种很多，不同的税种采取不同的征收方式，其中绝大多数税种的征收都考虑了纳税人的负担能力而实行定额、定率或核定征收的方式，只有少数情况下会实行全额实征的办法（比如对于违法经营的企业或者个体商户）。在多数情况下，由于采用定额、定率和核定征收的方法，税务机关很难精确地计算出每一个纳税人应当缴纳的税款，为了实现税费的最终征收，只能采用“多退少补”的办法，即只要纳税人总的应缴税金没有变化，税务机关不追究个别项目多交少交的情况。
在这种征纳模式下，尽管纳税人在申报时可能受到税务部门核定的应纳税额的限制，但最终实际缴纳的资金数额并不一定就完全取决于这个核定的数，因为在实际执行过程中，税务局在考核纳税人的时候并不能将每个纳税人每一笔交易的利润都计算得清清楚楚，再加上税收优惠等政策因素，最终实际缴纳的资金数额会受到很多其他因素的影响。当然，这些影响最终都会体现在税务部门的账面上，通过财务报表反映出来。
回到问题来，如果A企业在纳税申报时，经税务部门审核其销售收入为100万元，增值税收入为85万元，所得税收入为16万元，附加费及教育费4万元。在以后期间的税务稽查过程中发现其中的30万是企业的非法所得，那么根据现有政策，税务部门可以采取追加征收的方法让其补缴这30万元的应纳税款和相应的滞纳金；但如果通过进一步审查，发现其实际成本比上述费用还要高，那么出于弥补漏洞、防止偷逃税款的目的，税务部门还可以让企业重新计算并补交相应的企业所得税。不过这种情况一般不会造成企业实际资金流的大幅变动——更多只会在税务部门的账面上有所反映罢了。
但是如果以后期间国家出台新的政策，对这种类型的交易明确按9%的税率征收增值税，则A企业原来多预缴的增值税就可以退还给企业了，但这部分资金已经作为政府的收入全部缴入国库，只是现在需要再流回企业账户而已。从本质上看这是政府对企业的一次补助行为。